Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms