Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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LHX9Q9NQ69 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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LHX9Q9NQ69 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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LHX9Q9NQ69 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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