Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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