Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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CHCHD4Q8N4Q1 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CHCHD4Q8N4Q1 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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