Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TPRNQ4KMQ1 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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