Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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