Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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LAMA3Q16787 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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