Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TNXAQ16473 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TNXAQ16473 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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TNXAQ16473 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TNXAQ16473 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TNXAQ16473 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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TNXAQ16473 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TNXAQ16473 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TNXAQ16473 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TNXAQ16473 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNXAQ16473 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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