Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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