Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms