Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms