Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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