Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
APOFQ13790 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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APOFQ13790 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
APOFQ13790 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
APOFQ13790 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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APOFQ13790 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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APOFQ13790 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
APOFQ13790 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
APOFQ13790 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
APOFQ13790 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
APOFQ13790 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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