Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms