Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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ITGB3BPQ13352 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
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ITGB3BPQ13352 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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ITGB3BPQ13352 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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ITGB3BPQ13352 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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ITGB3BPQ13352 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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ITGB3BPQ13352 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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ITGB3BPQ13352 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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