Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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