Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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