Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms