Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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