Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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