Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TTPAP49638 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
TTPAP49638 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TTPAP49638 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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