Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CENPFP49454 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CENPFP49454 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CENPFP49454 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CENPFP49454 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms