Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms