Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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