Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms