Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms