Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms