Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DTX3Q8N9I9 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DTX3Q8N9I9 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DTX3Q8N9I9 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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