Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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