Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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