Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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FOXD1Q16676 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXD1Q16676 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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