Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CDKN3Q16667 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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