Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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