Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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