Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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NCOA1Q15788 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCOA1Q15788 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCOA1Q15788 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCOA1Q15788 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCOA1Q15788 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCOA1Q15788 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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NCOA1Q15788 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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NCOA1Q15788 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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NCOA1Q15788 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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NCOA1Q15788 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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