Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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