Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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