Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms