Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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