Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms