Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4BQ13620 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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