Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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