Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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C1orf61Q13536 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
C1orf61Q13536 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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