Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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