Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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