Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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