Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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