Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SRSF5Q13243 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms