Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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USP4Q13107 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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USP4Q13107 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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USP4Q13107 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP4Q13107 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP4Q13107 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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