Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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